Опоры служат базой для крепления поперечных дуг. В зависимости от конструктивных особенностей кузова автомобиля используется тот или иной тип опор. На данный момент система «Атлант» имеет 4 варианта опор: В, С, D и Е. Все типы опор изготовлены из полиамида высокой прочности. Нижние части опор снабжены резиновыми подушками, цель которых – распределение нагрузки и сохранение лакокрасочного покрытия крыши. Фиксирующие винты опор закрыты крышками с замками-секретками, предотвращающими несанкционированный демонтаж багажника.